月明星稀~再見新選組~

土方歲三以「鬼副長」之名，將新選組打造成無可比擬的武裝集團。一生貫徹真正武士精神的歲三，原本乃是農民之子。身為男人，他希望超越現在的自己，心無旁騖地以武士作為目標。在風雲告急的江戶末期，歲三的心在現實與理想之間擺盪。就在此時，與近藤勇的邂逅大大改變了歲三的命運。前往江戶，發憤在天然理心流道場‧試衛館當中修行的歲三……眾所期待的土方歲三青春記，堂堂登場！

歲三一邊販賣石田散藥，一邊走遍各地道場，出現在他眼前的是北辰一刀流的坂本龍馬，被劍術上壓倒性的強勁和志氣之高所擊潰，一瞬間重挫了歲三成為武士的念頭。此外，在日野的爭執成為導火線，大源流的武士們前來報復，就連沖田惣次郎都遭此事波及，害得年幼的他被迫殺人，為了和大源流做個了結，決心離開試衛館的歲三會有怎麼樣的明天……？眾所期待，故事進展到京都新選組篇的第二彈登場！

進京加入壬生浪士組的歲三得到了武士的頭銜，但是隊上卻分裂成試衛館派及水戶派，展開權力爭奪，首席局長‧芹澤鴨的心腹‧新見錦厭惡歲三這個人，為了要除掉他而接近土佐勤王黨的殺手‧岡田以藏，隊士們接二連三受到襲擊，一一被殺……此外就連無關的少女也成為犧牲品……認為隊上的行動被看穿的歲三相信新見就是內奸，之後與終於出現在眼前的岡田以藏進行對決，歲三拔出了劍……！

透過岡田以藏，歲三提出要清肅企圖暗殺近藤及土方的新見。另一方面，得知新見背叛之後，芹澤為了要將土方等人的目光從新見身上轉移開來，因此儘可能地在街頭施暴。就在此時，鼓吹推翻幕府的長州藩終於在大和舉兵，壬生浪士也接獲出動命令。此即八‧一八政變。政變之後，壬生浪士組終於獲賜新選組之名。而新選組首次接獲的命令，就是清肅局長‧芹澤鴨……！

得天子陛下（天皇）賜封「新選組」之名的壬生浪士組，接獲來自會津藩的第一件任務……！整肅芹澤鴨。但是近藤袒護因新見錦之死，而改頭換面整飭隊務的芹澤，默視會津的命令。得真會津用意的歲三，決定親手執行暗殺芹澤的行動。與沖田、山南、原田一同斬殺芹澤。得知此事的近藤命令歲三切腹。不過也瞭解歲三是為了保護近藤的生命才執行骯髒的工作。比任何人都痛心芹澤之死的歲三，製作了「局中法度書」，引領新選組成為更加鞏固的集團……！

在大坂斬殺奉行所輔佐‧內山彥次郎，獲知長州藩密謀的新選組，雖然回到京都探查尊攘激派的動向，但卻掌握不住實證……就在此時，歲三遇見坂本龍馬，因而得知燒燬京都計畫的一隅。之後，逮捕尊攘激派一夥的古高俊太郎，成功讓他招出計畫的全貌！他們決定要先下手為強，逐一搜查京都當中的茶店、旅店，分成近藤隊、土方隊兩路開始搜索！人數少的近藤隊，發現了根據地‧池田屋，決定靠著僅僅五個人殺進去……！之後，新選組最大的逮捕事件展開了！

得知尊攘激派的計謀──燒燬京都計畫的新選組，分成近藤隊、土方隊兩路，一一搜索京都的茶店及旅店！人數少的近藤隊，找到了根據地‧池田屋，以僅僅五人的陣容進攻！在藤堂受傷、沖田發生異變之時，土方隊也隨後趕到，一口氣殲滅了敵人！是有新選組的保護才能活命羅……新選組一躍成為京都的英雄，不過卻和另外一個維護京都治安的組織──京都見回組三不五時產生衝突……？

新選組開始搜捕在池田屋逃過一劫的幕後黑手，長州的桂小五郎！不過，在進行的過程中與同樣追捕桂的京都見回組產生衝突，就在此時，因為見回組的錯誤情報，會津的士兵‧柴司用槍誤傷了土佐藩士……柴負起責任切腹。無法接受的歲三獨自前往見回組的所在地…？另一方面，與新選組及會津有仇的長州，聚集兵力前往京都……之後，前所未聞的大動亂，禁門之變揭開了序幕！〈2006年2月22日上市〉

(完結篇)為了招募新隊士，近藤、永倉、藤堂等人前往江戶…另一方面，留在京都的歲三不是追捕無法維生而成為強盜的志士、就是與會津藩的大人物開會，以代理局長的身分過著忙碌的生活。渡海前往江戶的近藤一行人，在藤堂的介紹下認識了伊東甲子太郎這號人物，他們認同伊東這個人，和他一起回到京都。不過，這位伊東的加入，將導致新選組爆發前所未有的混亂…？(2006年8月4日上市)